Nantinya, peserta yang lulus SNPDB harus mendaftar ulang pada 20–23 Maret 2023. Setelah lolos semua tahapan seleksi, siswa akan mulai masuk asrama pada 25 Juli 2023.
Isom membeberkan, jumlah pendaftar madrasah unggulan tahun ini mengalami kenaikan. Tren kenaikan bahkan terjadi sejak lima tahun terakhir.
Misalnya pada tahun 2019/2020, jumlah pendaftar ada 13.976. Lalu pendaftar pada 2020/2021 ada 17.347 siswa, dan pendaftar pada 2021/2022 ada 17.422 siswa. Lalu, pada tahun ajaran 2022/2023, jumlah pendaftar ada 21.858 siswa. Kemudian, jumlah pendaftar meningkat drastis pada tahun ajaran 2023/2024, mencapai 29.237 siswa.
Dari pendaftar sejumlah 29.237 siswa ini, sebanyak 23.480 siswa mendaftar MAN IC, 4.699 siswa mendaftar MAN PK, dan 1.148 siswa mendaftar di dua MAKN.
Khusus untuk peserta SNPDB MAN IC, Isom menyebutkan kalau jumlah pendaftar MAN IC Pekalongan 2023 tertinggi dibanding MAN IC lainnya se-Indonesia. Pendaftar MAN IC Pekalongan tahun ini mencapai 4.213 siswa.
Disusul kemudian pendaftar MAN IC Serpong sebanyak 3.413 siswa, dan MAN IC Kota Padang Pariaman sebanyak 2.973 siswa. Sedangkan tiga madrasah dengan jumlah pendaftar paling sedikit adalah MAN IC Palu (175 siswa), MAN IC Halmahera Barat (254 siswa), dan MAN IC Gowa (323 siswa).
Untuk Kategori MAN PK, pendaftar terbanyak adalah MAN 1 Surakarta (1.408), lalu MAN 2 Padang Panjang (879), dan MAN 1 Yogyakarta (430).
Adapun MAN PK dengan pendaftar paling sedikit tahun ini adalah MAN 2 Samarinda (160), sebanyak 534 siswa mendaftar di MAKN Ende, dan 441 mendaftar di MAKN Bolaang Mongondow.